Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CA13Q8N1Q1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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CA13Q8N1Q1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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CA13Q8N1Q1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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CA13Q8N1Q1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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CA13Q8N1Q1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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CA13Q8N1Q1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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CA13Q8N1Q1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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CA13Q8N1Q1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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CA13Q8N1Q1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CA13Q8N1Q1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CA13Q8N1Q1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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