Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GPC2Q8N158 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GPC2Q8N158 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GPC2Q8N158 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPC2Q8N158 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GPC2Q8N158 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPC2Q8N158 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms