Protein–RNA interactions for Protein: Q8N145

LGI3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI3Q8N145 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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LGI3Q8N145 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LGI3Q8N145 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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