Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z3

SPICE1, Spindle and centriole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICE1Q8N0Z3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPICE1Q8N0Z3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SPICE1Q8N0Z3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPICE1Q8N0Z3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms