Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms