Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOT1Q8IXI2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOT1Q8IXI2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms