Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRSK2Q8IWQ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRSK2Q8IWQ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRSK2Q8IWQ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms