Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSIG1Q86XK7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms