Protein–RNA interactions for Protein: Q86W28

NLRP8, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP8Q86W28 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP8Q86W28 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP8Q86W28 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP8Q86W28 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP8Q86W28 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP8Q86W28 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP8Q86W28 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP8Q86W28 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP8Q86W28 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NLRP8Q86W28 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP8Q86W28 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP8Q86W28 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms