Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAINQ86UA6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPAINQ86UA6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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