Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRAPQ7Z569 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRAPQ7Z569 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRAPQ7Z569 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRAPQ7Z569 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms