Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SV2BQ7L1I2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SV2BQ7L1I2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.9 ms