Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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USP43Q70EL4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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USP43Q70EL4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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USP43Q70EL4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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USP43Q70EL4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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USP43Q70EL4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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USP43Q70EL4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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USP43Q70EL4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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USP43Q70EL4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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USP43Q70EL4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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USP43Q70EL4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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