Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP34Q70CQ2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
USP34Q70CQ2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP34Q70CQ2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
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