Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAXIP1Q6ZW49 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAXIP1Q6ZW49 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms