Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU65

UBN2, Ubinuclein-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN2Q6ZU65 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBN2Q6ZU65 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
UBN2Q6ZU65 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBN2Q6ZU65 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms