Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
UBR3Q6ZT12 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
UBR3Q6ZT12 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBR3Q6ZT12 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBR3Q6ZT12 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
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