Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN12Q6ZSI9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN12Q6ZSI9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN12Q6ZSI9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms