Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LIAT1Q6ZQX7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LIAT1Q6ZQX7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms