Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY4Q6ZNE9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RUFY4Q6ZNE9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms