Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDZRN4Q6ZMN7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDZRN4Q6ZMN7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms