Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACD2Q6Y1H2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD2Q6Y1H2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD2Q6Y1H2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms