Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MUC6Q6W4X9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MUC6Q6W4X9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms