Protein–RNA interactions for Protein: Q6VN20

RANBP10, Ran-binding protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP10Q6VN20 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANBP10Q6VN20 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANBP10Q6VN20 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANBP10Q6VN20 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RANBP10Q6VN20 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RANBP10Q6VN20 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RANBP10Q6VN20 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RANBP10Q6VN20 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RANBP10Q6VN20 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RANBP10Q6VN20 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RANBP10Q6VN20 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RANBP10Q6VN20 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms