Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRIG3Q6UXM1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG3Q6UXM1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIG3Q6UXM1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms