Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI9

NPNT, Nephronectin, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPNTQ6UXI9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPNTQ6UXI9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms