Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU1

KCNV1, Potassium voltage-gated channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNV1Q6PIU1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNV1Q6PIU1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNV1Q6PIU1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNV1Q6PIU1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNV1Q6PIU1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNV1Q6PIU1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNV1Q6PIU1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNV1Q6PIU1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNV1Q6PIU1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNV1Q6PIU1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNV1Q6PIU1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNV1Q6PIU1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNV1Q6PIU1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNV1Q6PIU1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNV1Q6PIU1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNV1Q6PIU1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNV1Q6PIU1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms