Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRAMD4Q6IC98 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms