Protein–RNA interactions for Protein: Q68CK6

ACSM2B, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2BQ68CK6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSM2BQ68CK6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACSM2BQ68CK6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2BQ68CK6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2BQ68CK6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2BQ68CK6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2BQ68CK6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2BQ68CK6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2BQ68CK6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2BQ68CK6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2BQ68CK6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2BQ68CK6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSM2BQ68CK6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms