Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GGNBP1Q5YKI7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GGNBP1Q5YKI7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms