Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DENND4CQ5VZ89 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms