Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM46CQ5VWP2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms