Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAF3Q5VWG9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF3Q5VWG9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF3Q5VWG9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms