Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BROXQ5VW32 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BROXQ5VW32 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BROXQ5VW32 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms