Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SFMBT2Q5VUG0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFMBT2Q5VUG0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms