Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACHD1Q5VU97 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACHD1Q5VU97 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms