Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RPRD2Q5VT52 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RPRD2Q5VT52 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms