Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPANXN1Q5VSR9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPANXN1Q5VSR9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms