Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C12orf60Q5U649 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
C12orf60Q5U649 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C12orf60Q5U649 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms