Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRTP1Q5TC63 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRTP1Q5TC63 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRTP1Q5TC63 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms