Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BEND3Q5T5X7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
BEND3Q5T5X7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms