Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC183Q5T5S1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC183Q5T5S1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms