Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM1

ZNF678, Zinc finger protein 678, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF678Q5SXM1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF678Q5SXM1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF678Q5SXM1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF678Q5SXM1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF678Q5SXM1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF678Q5SXM1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF678Q5SXM1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF678Q5SXM1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF678Q5SXM1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF678Q5SXM1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF678Q5SXM1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF678Q5SXM1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF678Q5SXM1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF678Q5SXM1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF678Q5SXM1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF678Q5SXM1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF678Q5SXM1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF678Q5SXM1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF678Q5SXM1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF678Q5SXM1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms