Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATAT1Q5SQI0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATAT1Q5SQI0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATAT1Q5SQI0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATAT1Q5SQI0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATAT1Q5SQI0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATAT1Q5SQI0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATAT1Q5SQI0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATAT1Q5SQI0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATAT1Q5SQI0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms