Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNT1Q5JUK3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNT1Q5JUK3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms