Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRB2Q5IJ48 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRB2Q5IJ48 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms