Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERC4Q5GLZ8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERC4Q5GLZ8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms