Protein–RNA interactions for Protein: Q59EK9

RUNDC3A, RUN domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3AQ59EK9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUNDC3AQ59EK9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC3AQ59EK9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms