Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX7

PLEKHG4, Puratrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHG4Q58EX7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PLEKHG4Q58EX7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PLEKHG4Q58EX7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms