Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALFQ53S48 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALFQ53S48 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms